Hipospadias, idrar yapılan deliğin açıldığı yere göre farklı sınıflandırılabilir. İdrar deliğinin uca çok yakın olduğu durumlara distar hipospadias diyoruz ki tedavisi en kolay olan hipospadias yapısıdır. Daha aşağıda olduğu durumlarda yani penis gövdesinde olduğu durumlarda buna penil hipospadias diyoruz bunlar da kendi aralarında distal penil, mid penil ya da proxmal penil hipospadias olarak adlandırılabilir. Bunların tedavisi biraz daha çetrefillidir bir de penisin torbalarla birleştiği bölge ya da anüs bölgesine çok yakın idrar yolu açılımları olduğu durumda bunları da proximal hipospadias denir. Özellikle proximal hipospadiaslarda ya da penil hipospadiaslarda seanslı yani basamaklı onarımlar gerekebilir.