Hipospadiasın tedavisi, daha önce bahsettiğim gibi cerrahidir ve özellikle çok dikkat gerektiren, çok tecrübeli ellerde yapılması gereken bir cerrahidir. Bu ameliyat sırasında sünnet derisini yama olarak kullandığımız durumlar mevcuttur. Dolayısıyla, hipospadiası olan çocukların kesinlikle sünnet edilmemesi gerekir. Ancak ameliyat sırasında, bu ameliyatı gerçekleştirecek cerrah tarafından sünnetin aynı anda veya ikinci bir seansta daha sonra yapılması tercih edilebilir.